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「碼農」和大佬的下一站,合成生物學 2021-11-01 15:23:33  來源:36氪

10 月 15 日,辭退了搜狗 CEO 的王小川表示,往后二十年,「想為生命科學和醫(yī)學的發(fā)展盡一份力」。這已經是今年第三位在辭職時對「生命科學」表示出興趣的互聯(lián)網大佬。

5 月 20 日,張一鳴在卸任字節(jié)跳動 CEO 的信中寫道,「生命科學……對人類生活的影響已現(xiàn)黎明之曙光」;3 月,黃崢在辭職信中說,「想去做一些食品科學和生命科學領域的研究」。

黃崢甚至在辭職信中寫了三個未來的研究方向:蛋白質機器人、植物合成蛋白「人造肉」、在作物種植過程中控制微量元素吸收。

想解決的問題各不相同,又有某些相通:對生物自然過程進行精微調控。再細究下去,這些研究可能都會涉及到目前最受關注的生物學領域「合成生物學」。

有人說,目前合成生物學就像 90 年代初的互聯(lián)網,剛剛過了嬰兒期,會出現(xiàn)一大批初創(chuàng)公司,說不定就會有下一個蘋果這樣的公司出現(xiàn)。

10 月初,我在上海參加了一場小熊貓生物發(fā)起的「Synbiopunk 2021 暨生物開發(fā)者大會」,試著理解「生命科學浪潮」(如果真的在到來的話)究竟可能是什么樣的?

大會現(xiàn)場 | 極客公園攝

01細胞工場

在會上,我又聽見人們談起「人造肉」。

沿襲計算機會議模式,自由交流的「unconference 自組織會議」上,有人邊喝啤酒邊聊:「合成生物學」有什么成功的產品?有人提到了 Impossible Food 旗下的「人造肉」。

Impossible Food 從沒有自稱「合成生物學」公司,但是將它與其它人造肉產品區(qū)分開來的核心賣點——那個讓素肉聞起來有獨特「肉香」的血紅蛋白,來自這門誕生 20 年左右的新興學科。

其中涉及的技術,就是用簡單的基因編輯,讓酵母產生「血紅蛋白」。套用一下合成生物學的術語,就是讓酵母菌就變成「細胞工廠」,按照人的意愿來生產物質。

是什么讓肉這么鮮紅,吃起來又有特殊的香氣呢?Impossible Food 認為是肉里面豐富的「血紅蛋白」。在各種食物中,都有血紅蛋白,但是動物肌肉中含量尤其多。

因此,血紅蛋白就被公司的創(chuàng)始人,生物化學家帕特里克·布朗(Patrick O. Brown)選擇作為模擬動物肉的「關鍵調料」。從植物中提取這種「調料」,布朗選中了根部含有豐富血紅蛋白的大豆。

傳統(tǒng)的生產方式需要從大豆根部直接提取「血紅蛋白」,一公斤的「血紅蛋白」就需要 6 畝大豆。植物提取耗費成本,Impossible Food 研發(fā)了新方式:將能編譯血紅蛋白的基因植入酵母菌中,隨著酵母菌生長和復制,就會生長出血紅蛋白。打個比喻,這就仿佛是在微生物的尺度上,讓鵝生下雞蛋。

從植物中提取的 血紅蛋白(Heme)用在「人造肉」?jié)h堡中

新技術提高生產效率,同時減少種植消耗的自然資源。由于主要的生產資料是酵母菌、糖、礦物質,也沒有太多化工廢料。想起來,這真是一種「讓未來更美好」的技術。

聽人們談起這個技術的時候,我感到這只一個簡單的技術。在他們眼中,可以這樣從基因層面設計,再生產出來的物質實在太多了??山到馑芰?、香料、新藥和疫苗、針對特定病害的農藥,甚至是用二氧化碳合成淀粉……我開始對生物技術帶來的可能有了些具體想象。

02工程思想遇到生物學:生物開發(fā)者

從命名上來說,這是全球第一場「生物開發(fā)者」大會。「生物開發(fā)者 Biodeveloper」這個詞是從 IT 領域常見的「開發(fā)者」沿用而來。

會議發(fā)起者,也是主辦方的「小熊貓生物」解釋說,生物科技行業(yè)的分工越來越細,開始出現(xiàn)了一個中間層群體,再用以前的生物工程師、研發(fā)科學家來稱呼似乎不夠涵蓋這個群體的豐富性。

小熊貓生物對自己的稱呼是「全球首家生物計算機」公司。大會的另外兩家主辦方分別是創(chuàng)業(yè)公司倍生生物、奇績創(chuàng)壇。倍生生物對自己的稱呼是「專注于物種設計的合成生物學公司」。

小熊貓生物 CEO 郭昊天解釋「生物開發(fā)者」命名的由來 | 小熊貓生物

IT 行業(yè)有各種各樣的開發(fā)者,比如網頁開發(fā)者、軟件開發(fā)者、游戲開發(fā)者。類似的,生物科技行業(yè)不同的人也會面對不同的研究對象、工作內容?!傅撬麄兊墓ぷ餍再|很相似,都是基于已有的知識、已有的工具、方法去開發(fā)新的產品和新技術」。

他們在做的事情,有些現(xiàn)在聽起來還挺陌生。比如發(fā)酵產品的菌株開發(fā)、底盤微生物重構、蛋白質藥物設計、分子育種、類器官改造。

合成生物學家 Tom knight 說,「21 世紀會是工程生物學的世紀」。他是合成生物學領域的創(chuàng)始者之一,也是合成生物學明星公司 Ginkgo Bioworks 的五位創(chuàng)始人之一。這家公司 9 月 18 日在紐交所上市,估值就達到了 150 億美元。

Tom Knight 的研究興趣經歷了從計算機到生物學的轉變。從高中時代開始,他就利用暑假在 MIT 學習計算機和編程,之后本科和研究生階段也在 MIT 度過。

Tom Knight

意識到摩爾定律預言了人類操作硅原子的極限,他將目光轉向了生物?!肝覀冃枰环N不同的方式,把原子放在正確的位置……最復雜的化學是什么?是生物化學。我想象可以使用生物分子,比如蛋白質,它們可以在你需要的范圍內自我組裝和結晶?!?/p>

用工程學定量、定性的思想來設計生物原件,成為新的研究方式。合成生物學像是人類知識的一次躍遷。作為一門工程學、計算機、生物學等多學科的交叉領域,合成生物學的起始之年被定為 2000 年。

在這一年發(fā)表的兩項研究中,生物學家用電路設計的思路,實現(xiàn)了對基因表達的控制。

波士頓大學的科學家在大腸桿菌中構建了基因開關 (Gene toggle switch)。這個模型只用了兩個基因模塊,通過調控外界刺激,可以讓基因的表達開或者關。

同樣是這一年,普林斯頓大學的科學家用了三個基因模塊,利用它們之間互相的抑制和抑制解除,實現(xiàn)了電路信號中的「震蕩」模式輸出。

基因開關(Gene toggle switch) 示意圖

03對基因讀、寫、改

DNA 從源頭上攜帶生命的所有信息,也是生命萬千性狀的來源。

發(fā)展到如今,人類已經能夠輕松地讀取 DNA 序列,按照設計合成 DNA 序列。會場上,我多次聽到人們談起獲得 2020 年諾貝爾化學獎的 CRISPR 技術。這項被稱作「基因魔剪」的技術,可以精準定位切割 DNA,從而實現(xiàn)基因編輯。

基于這項基因編輯技術,已經出現(xiàn)了多家創(chuàng)業(yè)公司。有的用它來解決癌癥、遺傳病等疑難疾病的基因治療,有的用它培育可供人類移植的器官、檢測疾病。

一項基因編輯技術如此快進入商業(yè)應用,讓人們看見生物技術的巨大前景。從生物技術自身的發(fā)展邏輯而言,在基因序列的讀取、合成、編輯都發(fā)展成熟之后,下一個階段,自然是從基因層面進行設計,來生產符合人類需求的物質。合成生物學技術,也可以理解為基因技術發(fā)展的下一個階段。

「很多人一直癡迷于合成生物學的定義……工程學科和生物學科之間發(fā)生了這種碰撞。我認為,由此產生的任何東西已經開始被命名為合成生物學。」Tom Knight 說。

將時間尺度拉大,遠從農業(yè)社會開始,人類就通過漫長的雜交和選種來篩選、保留自己想要的動植物性狀。合成生物學則是從基因層面直接入手,生成人類想要的性狀。眼下,科學家已經在實驗室里用 CRISPR 技術培育水稻。

大會的主辦方之一,奇績創(chuàng)壇創(chuàng)始人陸奇在開場視頻中說,生物技術可能會像之前的互聯(lián)網技術一樣,對世界帶來廣泛的變革。這似乎也印證了互聯(lián)網 CEO 辭退時都表達出對生命科學的興趣。

互聯(lián)網大佬們都紛紛投來關注的目光,生命科學的商業(yè)大勢終于要來了嗎?

湊巧的是,在「生物開發(fā)者」大會開始的前幾天,上市不久的 Ginkgo 遭遇了做空機構的質疑。在大會期間,公司的股票價位正經歷上市以來最低位。(雖然現(xiàn)在已經恢復)這讓「商業(yè)模式」這個話題更吸引人。

04商業(yè)故事剛剛開始:平臺和選品

和互聯(lián)網時代的巨頭一樣,Ginkgo 是一家說「平臺故事」的公司。

將自己定義為「細胞編程技術供應商」,Ginkgo 說的是一個「細胞編程」重塑生產方式的故事:用編程過的細胞作原料,制造食物、材料、新藥、香料……

公司 CEO 表示,Ginkgo 是一個技術平臺,它不生產產品,而是在其它公司研發(fā)產品階段提供服務而收費、或是大規(guī)模生產后獲得抽成。

如果生物生產的方式將帶來廣泛變革,技術平臺一定會成為行業(yè)中的巨頭。Ginkgo 剛剛上市時,來自紐約 Pinnacle Associates 的投資經理 Randy Baron 評論道:「這要么是有史以來最大的空頭,要么是下一個 AWS」。

Tom Knight(左一) 和其它四位 Ginkgo Bioworks 創(chuàng)始人 | Ginkgo Bioworks

既然技術前景樂觀,孵化出了什么產品?這是 Ginkgo 面臨的一大質疑。還沒出現(xiàn)強營收能力的產品,平臺估值就水漲船高。用互聯(lián)網的發(fā)展來打比方,這就類似于還沒有出現(xiàn)「殺手級應用」,大家已經在想象未來的行業(yè)巨頭。

聽會上的討論,人們反復提到「選品」。看起來,大家已經達成共識,「選品」是目前合成生物學創(chuàng)業(yè)公司至關重要的能力。

前不久,Impossible Food 傳出了 IPO 消息。憑借「血紅蛋白」這項標志技術打下一片市場,這是 Imposeeible Food 提供的成功產品經驗。

但換一個市場就未必可行,畢竟在中國「植物肉」只是小部分消費者的需求。

人們談論更多的,還是合成生物學公司在選品上走過的彎路。

合成生物學領域的第一家上市公司 Amyris 此前靠產生青蒿酸(artemisinic acid)的酵母菌株被資本看好。青蒿酸是生產青蒿素的前體。青蒿素就是在 2015 年,讓中國科家屠呦呦獲得諾獎的抗瘧疾藥。

實現(xiàn)青蒿素量產,讓 Amyris 成功上市,但卻沒有讓它賺錢。最初,合成生物法產青蒿素的確解決了化工合成成本過高的問題。但是隨著非洲大面積種植黃花蒿成功,植物提取成本下降,合成生物量產優(yōu)勢又不復存在。

實現(xiàn)生物合成青蒿素的科學家 Jay Keasling ,后來他寄希望的生物燃料商業(yè)上也沒有成功

青蒿素之后,Amyris 又把目光轉生物燃料??雌饋砗苊篮茫荷锊牧先〈牧?,是能源危機的出路。只是化石燃料的低生產成本面前,生物合成法沒能建立優(yōu)勢。現(xiàn)在,Amyris 又選擇了護膚品,用生物燃料的原材料「法尼烯」來生產維生素 E、角鯊烷。

在生產可降解塑料 PHA 上摸索了五年之后,藍晶微生物在今年 2 月份獲得了 2 億元 B 輪融資。這也成為國內合成生物學單筆最大融資。藍晶接下來將建設 PHA 年產萬噸級工廠。

合成生物學目前的考題似乎是:要向市場說明產品優(yōu)勢。

05未來:生物技術的產品多久會到來?

我問一位參會的從業(yè)人員,現(xiàn)在合成生物學發(fā)展到什么階段了? 他說,很像 90 年代初的互聯(lián)網,剛剛起步,又充滿想象。但是也會有所不同,中國和美國的差距沒有當時那么大,在發(fā)展的過程中,生物技術和傳統(tǒng)行業(yè)的聯(lián)系也會更緊密。

在會上,我遇到對新生產方式贊嘆不已的人,是一位香料公司的經理。他來自馨之源科技,主要的產品是龍涎香的原料「降龍涎香醚」。

龍涎香是高級香水的「定香劑」。自然界中的龍涎香源于抹香鯨的腸胃分泌物,非常珍貴,號稱香料之王,主要的作用就是定香。

甚至可以說,有了龍涎香,才有了現(xiàn)在常見的「品牌香水」。它讓香氛穩(wěn)定,留香時間能從 40 分鐘延長到 4 小時。除了高檔香水,它更常見的使用是被添加在洗發(fā)水、沐浴液,洗衣液等日化產品里,少量用于食用香精。

自然界最接近龍涎香的產品源于 1930 年代德國漢高公司。以香紫蘇花做原料,先進行植物提取,再經過多道化學反應,經歷香紫蘇醇、到香紫蘇內酯的過程,最后生成降龍涎香。

從 2016 年開始,他的公司能夠用生物合成的方法,將香紫蘇醇轉化為香紫蘇內酯。分子轉化率和純度能達到 99.8%。「作為一家細分領域的小型冠軍企業(yè),我們體會到合成生物學的意義非常大」,他說。

和化學合成相比,生物合成不僅轉化率和純度明顯提高,還避免了會帶來污染的高錳酸鉀廢水。接下來,他希望能夠技術上再突破,從「糖」直接生物合成更多的香料產品。這樣就可以跳過植物提取,節(jié)省土地成本、生產也更低碳。

午餐席間,我聽到一條新聞:聯(lián)合利華 9 月 2 日表示,它將投資 10 億歐元,用于在 2030 年前淘汰清潔產品原材料中的化石燃料。

在 10 年內,保潔生產的洗衣液、洗衣粉、香皂類產品都會逐漸采用植物原料、或者碳捕捉技術。公司還拿出另 10 億歐元設立基金,資助研究生物技術、二氧化碳等減少碳排放的技術。

告訴我這個新聞的人,和聽到新聞的我一樣,對不到 10 年的期限有些訝異:技術研發(fā)到大規(guī)模生產,這么快就會完全實現(xiàn)嗎?

不過我希望真的會實現(xiàn)。

公眾號“極客公園”(ID:geekpark),作者:凌晨,36氪經授權發(fā)布。

關鍵詞: 大佬 生物學 一站

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