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如何通過人臉識別發(fā)現(xiàn)兒童罕見疾?。?/span> 2022-03-30 18:29:08  來源:36氪

世界上有1萬多種罕見疾病,其中的75%會影響兒童,而受影響的孩子中有大約三分之一活不到5歲生日。

罕見疾病不會引起太多的關(guān)注,而且它們的檢測非常具有挑戰(zhàn)性。而現(xiàn)在,計算機視覺就可以診斷這些罕見病。

安德魯(為了保護孩子的身份而使用的假名)正在夏日的陽光下于后院玩耍,但這個4歲孩子的父母似乎注意到有些不對勁。也許是因為他的頭小得不尋常,也許是因為矯正他先天性疾病的手術(shù)所帶來的后遺癥。

安德魯?shù)母改缸稍兞朔鹆_里達州Nemours兒童醫(yī)院(Nemours Children’s Hospital)的兒科教授Karen Gripp博士,后者決定進行調(diào)查。除了常規(guī)的程序外,她還在Face2Gene上進行了快速診斷——這是一款基于計算機視覺的應(yīng)用程序,可以尋找罕見疾病的跡象。上傳至該應(yīng)用程序的安德魯面部圖片顯示,其癥狀與Smith-Lemli-Opitz綜合征(SLO)非常吻合。這是一種罕見的疾病,大約每4萬名兒童中會有1名患者。

“這家人以為這種情況已經(jīng)被排除了,”Karen Gripp說。但隨后的檢查證實了這一基因診斷結(jié)果。安德魯?shù)拿娌刻卣鞅砻魉加休p度SLO。盡管這對他的父母來說是一個打擊,可安德魯還是很快被送進了代謝疾病診所,并接受了適當(dāng)?shù)臓I養(yǎng)和藥物治療。

Karen Gripp表示,“這個家庭對于能夠獲得明確的診斷結(jié)果表示很感激,因為這能解釋孩子在行為和學(xué)習(xí)上遇到的挑戰(zhàn)。”他們現(xiàn)在意識到,對安德魯來說,SLO有25%的復(fù)發(fā)風(fēng)險。

世界上有1萬多種罕見疾病,其中的75%會影響兒童,而受影響的孩子中有大約三分之一活不到5歲生日。罕見疾病不會引起太多的關(guān)注,而且它們的檢測非常具有挑戰(zhàn)性。

在安德魯?shù)牟±?,多虧了人工智能計算機視覺應(yīng)用程序,他獲得了快速診斷,從而在治療上取得了突破。那么,面部圖片是這些致命疾病的可靠指標嗎?在可供算法進行訓(xùn)練的信息如此之少的情況下,人工智能能夠檢測罕見疾病嗎?本文將對這些問題展開討論,并分享當(dāng)今醫(yī)生在采用這些解決方案時的做法。

罕見病是如何隱藏在我們眼皮底下的?

兩個因素使得罕見的遺傳性疾病更加致命——缺乏認識,以及缺乏有針對性的治療。

每12個嬰兒中就有1個在生下來時患有罕見疾病。盡管全世界有3億多罕見疾病患者,但人們對這些疾病的認知水平很低。由于影響兒童的罕見疾病超過1萬種,相關(guān)病例的長尾分布非常分散。與安德魯不同的是,大多數(shù)孩子的病情多年來一直沒有被發(fā)現(xiàn),直到癥狀變得嚴重。而讓情況更復(fù)雜的是,找到遺傳學(xué)家并不容易,光是預(yù)約就可能需要幾個月的時間。

由于制藥公司優(yōu)先為影響大量人口的疾病研發(fā)藥物,大多數(shù)罕見疾病都缺乏治療方法。由于每種罕見疾病的患者只有幾千人,商業(yè)化研究手段無法實行。盡管對罕見病的治療有激勵措施,但罕見病藥物的研發(fā)卻被邊緣化了。

不過,面對作出正確診斷和提供高質(zhì)量護理的雙重挑戰(zhàn),技術(shù)正催生出新的解決方案。

用人工智能視覺檢測罕見疾病

“你能確定某人患有唐氏綜合癥嗎?”專注于計算機視覺領(lǐng)域的連續(xù)創(chuàng)業(yè)家Moti Shniberg問道。唐氏綜合癥是一種導(dǎo)致兒童智力殘疾和發(fā)育遲緩的遺傳性疾病,而該疾病會表現(xiàn)出明顯的面部狀況,很容易識別。

由于每700個兒童中有1個受到該疾病影響,“我們很有可能遇到過患有這種疾病的人,”Moti Shniberg表示?!霸谧畛蹩戳藥讉€患有該疾病的孩子之后,作為人類的我們往往會立即發(fā)現(xiàn)這些病例。我們的大腦在沒有任何專業(yè)醫(yī)學(xué)知識的情況下,就被訓(xùn)練成能直觀地發(fā)現(xiàn)這種病癥?!?/p>

然而,即便是專家,要想將這一視覺技能擴展到其他罕見疾病也是一項挑戰(zhàn)。成千上萬的罕見疾病有著截然不同的癥狀,而每一種疾病只影響全球數(shù)千名兒童,我們的大腦沒有足夠的例子來進行學(xué)習(xí)。

這就是計算機視覺可以提供幫助的地方。為此,Moti Shniberg創(chuàng)建了Face.com,這是一個面部識別平臺,在互聯(lián)網(wǎng)上發(fā)現(xiàn)了超過180億張臉。2012年,他把公司賣給了Facebook。當(dāng)他和搭檔Lior Wolf試圖用計算機視覺和深度學(xué)習(xí)來解決其他有影響力的問題時,他們偶然發(fā)現(xiàn)了在罕見遺傳性疾病中的應(yīng)用機會。

于是,他們成立了FDNA公司,并開始開發(fā)由人工智能驅(qū)動的應(yīng)用程序,如Face2Gene,以便用視覺方式來檢測罕見的遺傳性疾病。其算法被設(shè)計成只從每一種罕見疾病的少數(shù)患者的歷史照片中進行學(xué)習(xí)。

在過去的十年里,F(xiàn)DNA通過與遺傳學(xué)家的合作建立了一個包含5,000種罕見疾病的數(shù)據(jù)庫。“我們的面部識別算法可以檢測到1,500種這類疾病,”Moti Shniberg解釋說。“其他3,500種疾病則利用了包括自然語言處理在內(nèi)的技術(shù)來進行臨床特征分析。”該數(shù)據(jù)庫是Face2Gene背后的支撐,其只需要通過智能手機拍攝的一張面部照片就能幫助診斷病情

AI視覺檢測與基因檢測相比效果如何?

2003年,科學(xué)家對整個人類基因組進行了測序。這一里程碑引發(fā)了社會對于基因分型(genotyping)如何檢測和治療遺傳性疾病的強烈關(guān)注。大約20年后的今天,許多公司可以花費小幾百美元對個人的完整DNA進行測序。然而,這些進步還沒有給遺傳性疾病的檢測帶來改變。

利用基因分型來發(fā)現(xiàn)疾病就像在海洋中尋找一艘失蹤的船只。“我們談?wù)摰氖谴罅康臄?shù)據(jù),因為我們的遺傳物質(zhì)非常復(fù)雜,”Karen Gripp說道。這種方法本身并不是很有效,至少現(xiàn)在還不是。

與此同時,表型分型技術(shù)(phenotyping)出現(xiàn)了顯著進步,該技術(shù)利用可觀察到的特征來了解生物,而其中便包括通過面部特征研究來發(fā)現(xiàn)潛在疾病。由于人工智能和計算機視覺能力有了新發(fā)展,由人工智能驅(qū)動的算法可以立即檢測出疾病。它們可以通過對醫(yī)學(xué)影像展開的視覺檢查,以及諸如人聲、打字模式和其他數(shù)字化生物標記等輸入信息來實現(xiàn)檢測。

在實踐中,基因分型和表型分型這兩種方法不是競爭的,而是互補的。面部表型可以作為一種初步的診斷工具,幫助我們快速、高效地確定候選名單。

“如果我們已經(jīng)對病人進行了評估,并知道了需要檢查的基因,那我們就有了一個非常好的鑒別診斷,”Karen Gripp解釋道?!敖酉聛恚瑢ξ覀儚幕驕y試中得到的數(shù)據(jù)進行分析就會簡單得多?!?/p>

這些解決方案的準確性如何?

面部檢測的算法很好,但并不完美。當(dāng)病人有潛在的嚴重疾病時,錯誤清除病人信息的代價會很高昂,而且對健康人士發(fā)出錯誤的警報也會引發(fā)負面影響。

FDNA在Nature Medicine上發(fā)表的文章中表示,他們的解決方案對前十名的預(yù)測有91%的準確性:也就是說,在91%的情況下,實際發(fā)生的疾病會出現(xiàn)在算法所推薦的前十種情況中。在這一點上,人工智能需要來自人類的幫助。

“這是一個提供建議的工具,我們不應(yīng)該指望它做出診斷,”Karen Gripp指出?!拔覀冎话阉鳛樵u估病人的一種額外工具?!倍?dāng)這樣的工具與醫(yī)生配對時,它可以變成一個強有力的臨床輔助。

這種方法在哪些領(lǐng)域可能會失敗?“這種解決方案不能解決單純的神經(jīng)退行性疾病,”Karen Gripp稱。在不涉及身體結(jié)構(gòu)變化的情況下,計算機視覺的用途是有限的,而這些領(lǐng)域是其他的生物標志物和臨床特征分析方法可以派上用場的地方。這種組合療法對于完整覆蓋1萬種罕見疾病至關(guān)重要。

算法偏見是另一個需要處理的風(fēng)險。賓夕法尼亞州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的醫(yī)學(xué)教授Jennifer Kraschnewski說:“在獲得更好的醫(yī)療保健服務(wù)的人群中,罕見疾病的確診率可能會更高。這可能會讓人工智能訓(xùn)練數(shù)據(jù)集在無意中存在偏差,從而更加難以識別在代表性不足人群中的罕見疾病,并對此產(chǎn)生下游效應(yīng)。”

臨床采用的情況

Moti Shniberg分享道,F(xiàn)DNA在去年與150個國家的5,000多家機構(gòu)進行了合作?!叭缃?,全世界大約70%的遺傳學(xué)家都在使用我們的工具。”另外,新冠期間遠程醫(yī)療的普及加速了FDNA的成功。其應(yīng)用程序可以很容易地集成到遠程醫(yī)療會議中,并根據(jù)患者的面部特征向醫(yī)生分享實時建議。

FDNA團隊正致力于將該工具推廣給兒科醫(yī)生,與遠程醫(yī)療公司合作,并直接向父母提供該應(yīng)用程序,以提高其認同度。該公司有一個雄心勃勃的目標,即在未來兩年內(nèi)將患者覆蓋范圍從2021年的8萬名擴大到100萬名以上。

實現(xiàn)人工智能工具的采用需要多管齊下?!搬t(yī)學(xué)院和醫(yī)學(xué)繼續(xù)教育課程必須將這些工具整合到實踐中,以確保我們在照顧患者時能適當(dāng)?shù)剡\用這些應(yīng)用,”Jennifer Kraschnewski補充道。

罕見遺傳性疾病治療方法的未來

盡管美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)在治療罕見遺傳性疾病方面提供了財政激勵,但這1萬種疾病中只有5%有相應(yīng)的治療方法。Moti Shniberg認為,他們的目標是幫助100萬罕見疾病患者,而這將引發(fā)連鎖反應(yīng)。

首先,通過簡單的點擊和上傳應(yīng)用程序,罕見病疾病將更容易被發(fā)現(xiàn),再加上強大的分發(fā)策略,罕見疾病的檢測會更簡單、更有效。

其次,更多罕見疾病患者的發(fā)現(xiàn)有助于達到吸引制藥公司關(guān)注所需的患者門檻,并推動針對新罕見疾病的藥物研發(fā)工作。

希望在未來,像安德魯這樣的孩子不需要等待數(shù)年才能得到正確的診斷和治療,能夠盡快過上高質(zhì)量的生活。

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